Catálogo CEIBA de la Biblioteca Central de FAUBA


Influence of epistasis on response to genomic selection using complete sequence data (Registro nro. 45526)

000 -CABECERA
campo de control de longitud fija nab a22 7a 4500
999 ## - NÚMEROS DE CONTROL DE SISTEMA (KOHA)
Koha biblionumber 45526
001 - NÚMERO DE CONTROL
campo de control 20180524121522.0
003 - IDENTIFICADOR DEL NÚMERO DE CONTROL
campo de control AR-BaUFA
005 - FECHA Y HORA DE LA ÚLTIMA TRANSACCIÓN
campo de control 20190513094044.0
008 - DATOS DE LONGITUD FIJA--INFORMACIÓN GENERAL
campo de control de longitud fija 180524t2017 fr |||||o|||| 00| 0 eng d
022 ## - NÚMERO INTERNACIONAL NORMALIZADO PARA PUBLICACIONES SERIADAS
Número Internacional Normalizado para Publicaciones Seriadas 0999-193X
024 ## - OTROS IDENTIFICADORES DOI
NUMERO NORMALIZADO O CODIGO 10.1186/s12711-017-0340-3
040 ## - FUENTE DE LA CATALOGACIÓN
Centro catalogador/agencia de origen AR-BaUFA
245 ## - MENCIÓN DE TÍTULO
Título Influence of epistasis on response to genomic selection using complete sequence data
520 ## - SUMARIO, ETC
Resumen o abstract Background: The effect of epistasis on response to selection is a highly debated topic. Here, we investigated the impact of epistasis on response to sequence-based selection via genomic best linear prediction (GBLUP) in a regime of strong non-symmetrical epistasis under divergent selection, using real Drosophila sequence data.
We also explored the possible advantage of including epistasis in the evaluation model and/or of knowing the causal mutations.
Results: Response to selection was almost exclusively due to changes in allele frequency at a few loci with a large effect. Response was highly asymmetric (about four phenotypic standard deviations higher for upward than downward selection) due to the highly skewed site frequency spectrum.
Epistasis accentuated this asymmetry and affected response to selection by modulating the additive genetic variance, which was sustained for longer under upward selection whereas it eroded rapidly under downward selection.
Response to selection was quite insensitive to the evaluation model, especially under an additive scenario. Nevertheless, including epistasis in the model when there was none eventually led to lower accuracies as selection proceeded. Accounting for epistasis in the model, if it existed, was beneficial but only in the medium term.
There was not much gain in response if causal mutations were known, compared to using sequence data, which is likely due to strong linkage disequilibrium, high heritability and availability of phenotypes on candidates.
Conclusions: Epistatic interactions affect the response to genomic selection by modulating the additive genetic variance used for selection. Epistasis releases additive variance that may increase response to selection compared to a pure additive genetic action. Furthermore, genomic evaluation models and, in particular, GBLUP are robust, i.e. adding complexity to the model did not modify substantially the response (for a given architecture).
653 ## - TÉRMINO DE INDIZACIÓN--NO CONTROLADO
Término no controlado ANIMAL
653 ## - TÉRMINO DE INDIZACIÓN--NO CONTROLADO
Término no controlado BIOLOGICAL MODEL
653 ## - TÉRMINO DE INDIZACIÓN--NO CONTROLADO
Término no controlado DROSOPHILA
653 ## - TÉRMINO DE INDIZACIÓN--NO CONTROLADO
Término no controlado EPISTASIS
653 ## - TÉRMINO DE INDIZACIÓN--NO CONTROLADO
Término no controlado GENETIC DATABASE
653 ## - TÉRMINO DE INDIZACIÓN--NO CONTROLADO
Término no controlado GENETIC SELECTION
653 ## - TÉRMINO DE INDIZACIÓN--NO CONTROLADO
Término no controlado GENETICS
653 ## - TÉRMINO DE INDIZACIÓN--NO CONTROLADO
Término no controlado GENOME
700 1# - ENTRADA SECUNDARIA--NOMBRE DE PERSONA
Nombre de persona Forneris, Natalia Soledad
Filiación Centre for Research in Agricultural Genomics (CRAG), CSIC-IRTA-UAB-UB Consortium, 08193 Bellaterra, Barcelona, Spain y Departamento de Producción Animal, Facultad de Agronomía, Universidad de Buenos Aires, C1417DSE Buenos Aires, Argentina. - e-mail : forneris@agro.uba.ar
700 1# - ENTRADA SECUNDARIA--NOMBRE DE PERSONA
Nombre de persona Vitezica, Zulma Gladis
Filiación GenPhySE, INRA, INPT, ENVT, Université de Toulouse, 31326 Castanet‑Tolosan, France
700 1# - ENTRADA SECUNDARIA--NOMBRE DE PERSONA
Nombre de persona Legarra, Andres
Filiación GenPhySE, INRA, INPT, ENVT, Université de Toulouse, 31326 Castanet‑Tolosan, France
700 1# - ENTRADA SECUNDARIA--NOMBRE DE PERSONA
Nombre de persona Pérez Enciso, Miguel
Filiación Centre for Research in Agricultural Genomics (CRAG), CSIC-IRTA-UAB-UB Consortium, 08193 Bellaterra, Barcelona, Spain y Departament de Ciència Animal i dels Aliments, Universitat Autònoma de Barcelona, 08193 Bellaterra, Barcelona, Spain y ICREA, Passeig de Lluís Companys 23, 08010 Barcelona, Spain. - E-mail : miguel.perez@uab.es
773 0# - ENLACE AL DOCUMENTO FUENTE/ENTRADA DE REGISTRO ANFITRIÓN
Título Genetics selection evolution
Número de control del registro SECS000092
Parte(s) relacionada(s) Vol.47, no.66 (2017), 14 p., grafs.
856 ## - LOCALIZACIÓN Y ACCESO ELECTRÓNICOS
Nombre electrónico 2017forneris
Tipo de formato electrónico application/pdf
Identificador Uniforme del Recurso http://ri.agro.uba.ar/files/download/articulo/2017forneris.pdf
856 ## - LOCALIZACIÓN Y ACCESO ELECTRÓNICOS
Identificador Uniforme del Recurso https://biomedcentral.com/
Nota pública LINK AL EDITOR
942 ## - ELEMENTOS DE PUNTO DE ACCESO ADICIONAL (KOHA)
Tipo de ítem Koha Recurso electrónico
942 ## - ELEMENTOS DE PUNTO DE ACCESO ADICIONAL (KOHA)
Tipo de ítem Koha Artículos y capítulos
976 ## - ETIQUETA LOCAL
Datos locales AAG
700 1# - ENTRADA SECUNDARIA--NOMBRE DE PERSONA
-- 29153
700 1# - ENTRADA SECUNDARIA--NOMBRE DE PERSONA
-- 7786
700 1# - ENTRADA SECUNDARIA--NOMBRE DE PERSONA
-- 67204
700 1# - ENTRADA SECUNDARIA--NOMBRE DE PERSONA
-- 67205

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